カラーマップを使用してマーカーのコレクションのスタイルを設定できます

ScottPlot.Plot myPlot = new();

double[] xs = Generate.Consecutive(51);
double[] ys = Generate.Sin(51);

var markers = myPlot.Add.Markers(xs, ys);
markers.Colormap = new ScottPlot.Colormaps.MellowRainbow();

myPlot.SavePng("demo.png", 400, 300);